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Purificação

Devido à natureza da síntese, o produto final pode conter oligos completos, uma porcentagem de sequências incompletas, restos de reagentes, sais e subprodutos. Por isso oferecemos três métodos de purificação para atender às necessidades da sua pesquisa.
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O que os nossos clientes acham

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Felipe Borges
Orientador
,
UNICAMP
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Caio Santos
Pesquisador
,
Bayer
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Clara Sampaio
Gestora de Compras
,
Natura

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Respondemos as dúvidas mais comuns de outras empresas

Por que o rendimento final do meu oligo não é igual à escala solicitada?

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A escala de síntese que você solicita é o que utilizamos como base para a escolha da quantidade de matéria inicial da síntese. A síntese de oligos é um processo químico e cíclico, em que o número de ciclos é igual ao número de bases do oligo solicitado por você. Esses ciclos, por características inerentes ao processo, não são 100% eficientes e, por este motivo, já no processo de síntese temos perdas em relação à matéria inicial. Além disso, também temos as perdas relacionadas ao processo de purificação (remoção de sais, subprodutos e sequências incompletas) e pequenas perdas nos demais processos de quantificação e secagem. Mas não se preocupe! Mesmo com todas as perdas do processo e a quantidade inicial sendo diferente da quantidade final, a gente garante pra você uma quantidade final de matéria mínima por escala inicial de síntese. Para saber exatamente a quantidade mínima garantida que você receberá do seu oligo e para mais informações sobre o assunto, clique aqui e acesse o nosso informativo completo.

Qual purificação devo escolher para os meus oligos?

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A forma de purificação adequada depende da configuração e da aplicação do seu oligo. Por exemplo, para oligos simples e curtos (até 30 bases) que serão aplicados em amplificações simples, você pode escolher a Dessalinização que é a opção de menor custo que temos na Exxtend. Se você está pedindo oligos um pouco mais longos ou vai utilizá-los para aplicações como PCR, qPRC, blotting, clonagem, sequenciamento ou mutagênese, recomendamos a purificação por RP-OPC. Ela tem um custo um pouco mais elevado, mas tem uma pureza mais elevada em relação à dessalinização. Mas caso você precise de oligos marcados que serão utilizados para multiplex ou como oligos antisense, então recomendamos a purificação por HPLC. É a opção de maior custo mas garante uma alta pureza do oligo. Para saber mais sobre as principais diferenças entre os processos de purificação, aplicações e mais recomendações, acesse o nosso informativo completo.

Modificações e marcações

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Na Exxtend temos várias moléculas para modificações internas e nas extremidades 5' e 3' dos oligos, que podem ser fluorescentes ou não. Alguns marcadores utilizados no mercado de oligos são patenteados (ex.: NED, VIC, JOE entre diversos outros), portanto não podemos sintetizar com essas moléculas. No entanto, temos moléculas com propriedades físicas semelhantes, que são lidas nos mesmos canais nos equipamentos de qPCR e portanto podem substituir as moléculas patenteadas. É importante ressaltar que antes de selecionar um fluoróforo para qPCR, você sempre deve verificar se o seu equipamento tem os canais compatíveis e se estão devidamente calibrados. Você pode acessar todo o nosso catálogo de modificações e marcações, assim como as possíveis substituições clicando aqui.
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